國內不少企業貫徹GAP系列標準建立起質量控制體系的做法和步驟，雖然各不相同，但有其共同之處，歸納起來，較為完善的工作程序和步驟大體可分為六個階段的活動。

1、進行職能分配，為建立良好農業規范質量控制體系打基礎
職能分配是一項艱巨復雜的企業管理工作，也關系到企業能否成功進行認證。首先企業要在自身的組織架構、人員組成及職能分配基礎上，成立一個GAP認證工作小組。小組成員由各部門負責人或其指定人員組成，組長由最高管理者確定，必要時，也可聘請外部咨詢機構參與管理。

第二是制定分配方案，對各部門的職能和活動進行分配，明確各部門承擔的職能。

第三是制定企業二級部門的工作標準，明確部門的職責和權限。企業二級部門行使質量監督職能和活動再分配，并在此基礎上制定部門內部機構和崗位人員的工作標準。最后制訂良好農業規范認證的工作計劃，并組織討論，形成最終方案。

2、學習掌握良好農業規范及相關的基礎知識
提高員工對GAP標準內容和產品基礎知識的科學認識，改變過去那種傳統的種植、養殖和加工的觀念。首先從標準的宣傳和培訓入手，采取走出去和請進來的方式，組織有關人員學習并掌握GAP系列標準及企業相關產品基礎知識，特別是有關食品安全、員工健康安全和福利、動物福利及可持續發展方面的知識，以保證GAP認證各項工作的順利推進。

3、編寫良好農業規范認證管理文件，做好基地的整理整頓工作
良好農業規范認證管理文件是建立GAP體系的一項關鍵工作，應下大力氣抓好。文件沒有統一的格式，企業可根據自己的實際情況靈活實施。文件基本上包括三個層次，第一層次是質量手冊，說明企業內部整體的管理方式，如組織機構、召回等。第二層次文件是程序文件或作業指導書及管理制度，如“茶葉種植規程” “庫房管理規定”等，是指導企業進行生產管理的內部標準。第三層次文件是與認證產品相關的生產、加工、經營活動的記錄，如“用藥記錄、灌溉記錄”。各文件可由相關部門自己起草，認真做好后集中審查，最終形成一套科學、規范、嚴密的GAP管理體系。
做好基地的整理整頓工作。企業根據GAP系列標準的基本要素完善基地條件，如建立健全可追溯性系統；改善生產環境、周邊環境及庫房的衛生情況；解決工人的健康福利問題；做好生產過程中可能出現的緊急事故的處理預案；做好能有效防止農業操作過程中的交叉污染，做好申請認證的產品和非認證其他產品的隔離措施；完善檢驗檢測體系，進行水源、空氣、土壤、產品的抽樣分析等，盡可能做到遵從系列標準相關的控制點要求。

4、學習和貫徹良好農業規范認證管理文件，并組織運行發布
GAP認證管理文件，并加強宣傳，組織各相關部門人員貫徹、學習GAP認證管理文件。
文件發布后，體系進入試運行階段，認證工作小組要定期對各部門的GAP控制體系的運行情況進行檢查和督促，促使各部門質量意識的形成，使之真正按照文件要求進行貫徹和落實，有計劃、有重點地開展各項農事活動，最終達到提高管理水平的目的。

5、開展內部審核和內部檢查，并申請認證
在GAP控制體系建立并運行一段時間后，首先參照GAP系列標準開展內部檢查，如申請單位為農業生產經營者組織，則還要利用認證實施規則進行農業生產經營者組織內部審核和內部檢查，以評價質量管理體系的適宜性，再對內部檢查及審核中所出現的不符合規范的措施積極糾正或組織質量改進。最后向經國家認證認可監督管理委員會批準的認證機構提交相關申請文件進行文件審核，準備認證。

6、認證階段
企業接受認證機構組織的外部檢查，采取適的糾正措施以整改檢查所發現的不符合項，看是否有超過規定的不符合項目最小百分比數字，如果沒有，認證機構批準認證，企業獲得證書；如果有，且采取糾正措施整改后仍然不達標者本次不能通過認證。認證機構每年對認證書持有人進行至少1次的外部檢查，以對其認證范圍內的產品重新確認。

綜上所述， GAP做為現代農業先進的生產管理指南，充分吸納了行業技術的精華，是按照國際標準的基準框架構建起來的一個完整體系，是標準化技術的普遍應用，因此農產品企業引進、實施良好農業規范勢在必行。但企業執行良好農業規范也是一項長期艱苦的工作，企業應用還應考慮現有的管理水平，當管理未達到要求時不必強求，否則，會適得其反。